BioUML
«BioUML» включено в реестр российского ПО: реестровая запись № 28339, решение Экспертного совета (протокол № 358пр от 22.05.2025). Правообладатель — ООО "БИОСОФТ.РУ". Заявление № 332727 от 23.04.2025.
Статус: Включено в реестр · Этап: В реестре · ПО
- Номер заявления
- № 332727, зарегистрировано 23.04.2025
- Правообладатель
- ООО "БИОСОФТ.РУ"
- Реестровая запись
- Реестровая запись №28339 от 06.06.2025
- Классы ПО
- 12.20 Информационные системы для решения специфических отраслевых задач; 10.03 Средства математического и имитационного моделирования; 11.04 Средства интеллектуального анализа данных (Data Mining)
О продукте
ПО BioUML (Biological Universal Modeling Language; https://www.biouml.ru/) является отечественной полнофункциональной биоинформатической платформой, созданной с использованием языков программирования Java и Javascript. Период разработки охватывает 2008 – 2025 гг. На разработку затрачено 100+ человеко-лет. Объем кода ПО (не включая сторонние библиотеки): а) Java – 6 199 файлов, объем 36.8 Мб, ~1.2 млн. строк кода б) JavaScript – 74 файла, 1.5 Мб, ~50 000 строк кода, в) количество плагинов – 194.
Что умеет
- BioUML cвоим функционалом охватывает практически весь спектр задач современной биоинформатики и системной биологии от формального описания сложных биологических систем и анализа Big Data, характеризующих эти системы, до итерационного создания их модульных моделей, имеющих иерархическую структуру. В состав разработанного ПО включены алгоритмы, подпрограммы, сценарии для анализа и графического представления биомедицинских данных, что позволяет использовать BioUML как инструментарий для персонализированной медицины будущего. Уникальными особенностями ПК BioUML являются:
- интеграция методов анализа данных, полученных с использованием современных высокопроизводительных технологий, с возможностями построения моделей сложных биологических систем (визуальное моделирование, автоматическая генерация моделей)
- поддержка широкого круга подходов к моделированию биологических систем: обычные дифференциальные уравнения (ОДУ) с задержкой переменных по времени и мгновенными событиями, стохастическое моделирование, генерация моделей на основе правил (rule based modeling), одномерные модели кровотока на основе уравнений в частных производных, анализ метаболических потоков (flux balance analysis) и метод линейного программирования, мультиагентное моделирование (agent based modelling). Отдельно стоит подчеркнуть, что в рамках BioUML все эти методы можно одновременно использовать при построении модульных моделей, в этом случае для их численного моделирование их динамики используется мультиагентное моделирование. По результатам независимых сравнений (Maggioli et al., 2019; doi: 10.1093/bioinformatics/btz860), ПО BioUML признан единственным в мире симулятором биологических моделей, который проходит все тесты на правильность численного моделирования биологических систем SBML Test Suite Core v3.3.0, а также является самым быстрым симулятором. По своим возможностям BioUML не имеет прямых аналогов в мире, что особенно важно для обеспечения технологического суверенитета Российской Федерации в этой области
- Свидетельство Роспатента
- № 2008612975 от 19.06.2008
- Код ОКПД 2
- 62 Продукты программные и услуги по разработке программного обеспечения; консультационные и аналогичные услуги в области информационных технологий
- ИНН правообладателя
- 5433172898
- Государство регистрации
- Россия
- Документация
- biouml.ru
- Стоимость и лицензия
- biouml.ru
По карточке заявления на сайте реестра, обновлена там 18.04.2025.
Решения Экспертного совета
- Включить в реестр — протокол № 358пр от 22.05.2025, голосование: за 19, против 0, воздержались 1; поручение оператору от 06.06.2025
- Класс программного обеспечения: Информационные системы для решения специфических отраслевых задач, Средства математического и имитационного моделирования, Средства интеллектуального анализа данных (Data Mining)
- Иностранное программное обеспечение, имеющее сходство функциональных характеристик: geneXplain, CellDesigner, Taverna, Galaxy, iBioSim
История заявления
- 06.06.2025 — реестровая запись № 28339
- 22.05.2025 — решение Экспертного совета: Включить в реестр (протокол № 358пр)
- 23.04.2025 — появилось в списке со статусом «Включено в реестр»
Похожие продукты в классе 12.20
- АйТи Капитал: Расчет рисков — Готовится экспертная оценка
- БИТ.МДМ — Готовится экспертная оценка
- Система поиска маршрутов Antereal Routes — Готовится экспертная оценка
- АйТи Капитал: Расчет страховых резервов — Готовится экспертная оценка
- Компьютерный имитационный тренажер 3D «Управление складированием» — Готовится экспертная оценка
- ПАН Партнер — Готовится экспертная оценка
- АРС.СИМ — Готовится экспертная оценка
- АИС "Система интеллектуального контроля закупочной документации" — Готовится экспертная оценка
Весь класс 12.20 Информационные системы для решения специфических отраслевых задач