OmicsPipe
«OmicsPipe» включено в реестр российского ПО: реестровая запись № 24358, решение Экспертного совета (протокол № 696пр от 08.10.2024). Правообладатель — ООО "ОМИКСЛАБ". Заявление № 310812 от 23.08.2024.
Статус: Включено в реестр · Этап: В реестре · ПО
- Номер заявления
- № 310812, зарегистрировано 23.08.2024
- Правообладатель
- ООО "ОМИКСЛАБ"
- Реестровая запись
- Реестровая запись №24358 от 18.10.2024
- Классы ПО
- 12.21 Программное обеспечение для решения отраслевых задач в области здравоохранения; 11.01 Инструменты извлечения и трансформации данных (ETL); 12.20 Информационные системы для решения специфических отраслевых задач
О продукте
«OmicsPipe» является программным обеспечением для последовательного преобразования данных ДНК-секвенирования (FASTQ файлы), полученных с помощью секвенатора нового поколения. Программа предназначена для последовательного преобразования данных ДНК-секвенирования с описанием последовательности в декларативном стиле с использованием контейнеризации для упрощения управления системными зависимостями и воспроизводимости результатов. Программа используется в научных исследованиях и в медицинской деятельности для накопления данных и их последующего анализа. Например, при поиске новых молекулярных мишеней, исследовании эффективности препаратов, поиске клинико-патологических зависимостей.
Что умеет
- Функциональные характеристики 1. Основные компоненты системы ./deps
- статические данные, необходимые для запуска биоинформатических программ, выполняющих преобразование данных. ./omicspipe/configs
- конфигурации, которые описывают последовательность преобразований данных ДНК-секвенирования. ./omicspipe/services
- описание сервисов и docker-образов, которые используются в файлах конфигурации. ./omicspipe/lib.py
- модуль, который читает файлы конфигурации и выполняет запуск контейнеров и команд внутри контейнера, для выполнения последовательных преобразований данных ДНК-секвенирования. ./omicspipe/run_pipeline.py
- точка входа программы, предоставляющая интерфейс командной строки для запуска последовательных преобразований данных. 2. Возможности сервиса
- Описывает последовательные преобразования данных ДНК-секвенирований в декларативном стиле
- Использует инструменты контейнеризации для запуска биоинформатических программ
- Возможность обновления версий сервисов и добавления новых сервисов
- Возможность изменения последовательности преобразований данных ДНК-секвенирований
- Возможность запуска последовательности преобразований данных ДНК-секвенирований через интерфейс командной строки ОС Ubuntu 22.04
- Возможность изменения статических данных, необходимых для выполнения преобразования данных биоинформатической программой
- Логирование процесса последовательного преобразования данных ДНК-секвенирования
- Свидетельство Роспатента
- № 2024664600 от 21.06.2024
- Код ОКПД 2
- 58.29.32 Обеспечение программное прикладное для загрузки
- ИНН правообладателя
- 7720397874
- Государство регистрации
- Россия
- Документация
- omicslab.ru
- Стоимость и лицензия
- omicslab.ru
По карточке заявления на сайте реестра, обновлена там 16.08.2024.
Решения Экспертного совета
- Включить в реестр — протокол № 696пр от 08.10.2024, голосование: за 20, против 0, воздержались 1; поручение оператору от 18.10.2024
- Класс программного обеспечения: Программное обеспечение для решения отраслевых задач в области здравоохранения, Инструменты извлечения и трансформации данных (ETL)
История заявления
- 18.10.2024 — реестровая запись № 24358
- 08.10.2024 — решение Экспертного совета: Включить в реестр (протокол № 696пр)
- 23.08.2024 — появилось в списке со статусом «Включено в реестр»
Похожие продукты в классе 12.21
- VR симулятор для отработки практических навыков. Взятие крови из периферической вены с помощью вакуумной системы — Готовится экспертная оценка
- Программное обеспечение «Лабораторная информационная система qMS» — Готовится экспертная оценка
- Dianapp — Готовится экспертная оценка
- Региональный кол-центр здравоохранения на базе ТМ:ЦОД — Готовится экспертная оценка
- Рабочее место врача - неонатолога — Готовится экспертная оценка
- АктионМедИИ Коннектор — Дана экспертная оценка
- Сервис проверки медицинских назначений АктионМедИИ — На доработке заявителем
- Программный комплекс «Система дистанционного мониторинга здоровья FIZO (ФИЗО)» — Готовится экспертная оценка
Весь класс 12.21 Программное обеспечение для решения отраслевых задач в области здравоохранения